24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1365 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1365  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  731    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5164  hypothetical protein  55.31 
 
 		 221 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.903907 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5429  protein of unknown function UPF0153  43.43 
 
 		 106 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0259414  hitchhiker  0.00694306 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1247  hypothetical protein  35.45 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2436  protein of unknown function UPF0153  43.01 
 
 		 108 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0093  hypothetical protein  39.58 
 
 		 106 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2209  hypothetical protein  39.8 
 
 		 108 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7105  hypothetical protein  34.62 
 
 		 106 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1698  hypothetical protein  36.36 
 
 		 118 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3008  hypothetical protein  36.08 
 
 		 103 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3596  hypothetical protein  35.16 
 
 		 108 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1919  protein of unknown function UPF0153  35.16 
 
 		 110 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54208  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1159  hypothetical protein  41.67 
 
 		 108 aa  49.7  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0028  protein of unknown function UPF0153  43.64 
 
 		 100 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186945  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1866  ferredoxin  36.7 
 
 		 134 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354364  normal  0.828444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1413  hypothetical protein  36.7 
 
 		 134 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.504066  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1860  ferredoxin  36.7 
 
 		 134 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1595  ferredoxin  36.7 
 
 		 134 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.640546 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1923  ferredoxin  36.7 
 
 		 134 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135966 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3004  hypothetical protein  32.99 
 
 		 114 aa  47.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2432  protein of unknown function UPF0153  32.99 
 
 		 116 aa  47  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2552  hypothetical protein  32.61 
 
 		 96 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22700  putative ferredoxin  33.68 
 
 		 123 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.025963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1450  protein of unknown function UPF0153  38.54 
 
 		 102 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>