More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03656 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03656  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  687    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2530  hypothetical protein  46.22 
 
 		 361 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  36.65 
 
 		 333 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3579  hypothetical protein  37.15 
 
 		 333 aa  208  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3401  hypothetical protein  36.31 
 
 		 334 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28160  hypothetical protein  36.02 
 
 		 328 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2599  hypothetical protein  36.02 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.733501  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  35.6 
 
 		 333 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  36.53 
 
 		 327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2812  glycosyl transferase family protein  35.98 
 
 		 337 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  34.78 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  35.09 
 
 		 333 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  35.09 
 
 		 333 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1161  hypothetical protein  34.78 
 
 		 327 aa  195  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.18822  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2381  hypothetical protein  36 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.0161209 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1665  hypothetical protein  35.71 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0848  hypothetical protein  35.52 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1873  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.597248  hitchhiker  0.00000310641 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05584  hypothetical protein  32.83 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001604  glycosyl transferase family 3  32.79 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1809  glycosyl transferase family protein  33.74 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3046  hypothetical protein  32.5 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0326711  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1670  hypothetical protein  31.37 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0478591  normal  0.302071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1507  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  35.89 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2767  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.0391357 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0253  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4280  hypothetical protein  28.53 
 
 		 506 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0234  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.226663 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2882  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 		 304 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1403  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 		 301 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3280  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 		 301 aa  96.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3794  hypothetical protein  26.06 
 
 		 491 aa  96.3  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516461  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1003  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 		 302 aa  92.4  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2690  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 		 309 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335373 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2293  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129801  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2842  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 		 309 aa  90.9  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2320  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3531  glycosyl transferase family protein  31 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2331  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 		 309 aa  89.7  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0852797  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2104  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 		 308 aa  89.7  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0754859  normal  0.466514 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0378  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1467  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0815  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303571  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1980  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 		 298 aa  86.3  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4332  hypothetical protein  30.91 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0327  glycosyl transferase family protein  24.21 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3637  hypothetical protein  28.38 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1680  hypothetical protein  31.58 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.99598 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2471  hypothetical protein  28.3 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2882  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0477  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.63 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1780  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.301488 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2369  glycosyl transferase family protein  32.8 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1762  Anthranilate phosphoribosyltransferase  29.21 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18281  hypothetical protein  24.54 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1487  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1594  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1586  Anthranilate phosphoribosyltransferase  26.64 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1273  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.03 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1483  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.58 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2494  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.35 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2660  hypothetical protein  25.19 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0870271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0461  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3065  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.92 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00243568  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4702  Glycosyl transferase, family 3-like protein  29.09 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1580  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29911  hypothetical protein  23.28 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5575  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.58 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3296  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0655575  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0824  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.993844 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0692  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.91 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00767  hypothetical protein  27.46 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2842  Glycosyl transferase, family 3-like protein  27.46 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0867  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00784  hypothetical protein  27.46 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0949  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0855  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2843  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0145  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.46 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00673476  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4534  hypothetical protein  27.96 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0738  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 		 354 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1444  anthranilate phosphoribosyltransferase  32.43 
 
 		 342 aa  67  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2142  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.03 
 
 		 339 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1290  glycosyl transferase family protein  25.49 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.127601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0358  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.05 
 
 		 340 aa  67  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.150136  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0555  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6141  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0570  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2822  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4143  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0858  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1301  hypothetical protein  22.85 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1487  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1837  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.11 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0102  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  31.35 
 
 		 349 aa  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>