18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01869 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01869  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0606  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2639  hypothetical protein  30.94 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0562456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1371  hypothetical protein  29.13 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1392  glutaredoxin  32.53 
 
 		 263 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1544  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152364  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0532  hypothetical protein  33.75 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.790547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2170  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000841913  hitchhiker  0.00518945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3206  hypothetical protein  26.67 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.053039 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05308  hypothetical protein  29.85 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2022  hypothetical protein  27.78 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0263  hypothetical protein  30.23 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0324257 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0150  hypothetical protein  22.3 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323748  normal  0.0553337 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1971  glutaredoxin  39.73 
 
 		 253 aa  41.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0151  hypothetical protein  43.66 
 
 		 151 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000574  hypothetical protein  30.22 
 
 		 147 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.561088  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1800  hypothetical protein  29.2 
 
 		 271 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3352  hypothetical protein  35.71 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>