29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01562 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01562  Prevent-host-death protein  100 
 
 
58 aa  117  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0458  prevent-host-death family protein  41.51 
 
 
93 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.159378  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0682  prevent-host-death family protein  41.82 
 
 
89 aa  50.8  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0956  prevent-host-death protein  42.59 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.790427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  37.04 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0125  addiction module antitoxin  56.1 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  2.17666e-21 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2187  prevent-host-death family protein  38.89 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1048  prevent-host-death family protein  38.89 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0759  prevent-host-death family protein  37.04 
 
 
87 aa  48.1  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1400  prevent-host-death family protein  51.28 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.917671  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2343  hypothetical protein  45 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554067  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0656  plasmid stabilization system antitoxin protein  37.04 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0240  prevent-host-death family protein  39.62 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4645  prevent-host-death protein  39.62 
 
 
82 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.547809  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1789  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  41.82 
 
 
95 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0532  prevent-host-death family protein  50 
 
 
91 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1042  prevent-host-death family protein  37.04 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.220339  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6553  prevent-host-death family protein  38.46 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00354401  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2237  prevent-host-death family protein  54.55 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.265001  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2017  hypothetical protein  38.6 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2751  ATPase  46.15 
 
 
91 aa  45.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0678  prevent-host-death protein  38.46 
 
 
99 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.893582 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5559  prevent-host-death family protein  36.54 
 
 
93 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199357  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0177  prevent-host-death family protein  40.43 
 
 
85 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1279  prevent-host-death family protein  35.19 
 
 
87 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04765  hypothetical protein  35 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1488  prevent-host-death family protein  29.09 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02601  hypothetical protein  37.74 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08232  prevent-host-death family protein  39.47 
 
 
89 aa  40.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000000278747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>