31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2496 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2496  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  246  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175447  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2193  protein of unknown function DUF1127  84 
 
 
50 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1572  hypothetical protein  66.67 
 
 
48 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713937  normal  0.572982 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5370  hypothetical protein  53.66 
 
 
48 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.157659 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1791  hypothetical protein  58.54 
 
 
46 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.601351  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0418  hypothetical protein  44.29 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0895  hypothetical protein  60.53 
 
 
48 aa  47.8  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0744293  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3375  hypothetical protein  55.26 
 
 
48 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0891  hypothetical protein  60.53 
 
 
48 aa  47.8  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2332  hypothetical protein  53.33 
 
 
48 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6602  protein of unknown function DUF1127  55.26 
 
 
48 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000878075 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5587  hypothetical protein  57.89 
 
 
48 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.512418  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5661  protein of unknown function DUF1127  55.26 
 
 
48 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647025  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1502  protein of unknown function DUF1127  55.26 
 
 
48 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1700  protein of unknown function DUF1127  58.82 
 
 
48 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.966723  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3167  protein of unknown function DUF1127  50 
 
 
50 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2481  hypothetical protein  48.78 
 
 
49 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.123002  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0682  hypothetical protein  55.32 
 
 
52 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0728  hypothetical protein  55.32 
 
 
52 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3865  hypothetical protein  55.32 
 
 
48 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6084  protein of unknown function DUF1127  50 
 
 
48 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2772  hypothetical protein  45.83 
 
 
50 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.559182  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2727  hypothetical protein  45.83 
 
 
50 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172753  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3291  hypothetical protein  46.94 
 
 
51 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0273  hypothetical protein  36.51 
 
 
71 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0392259  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2771  hypothetical protein  47.92 
 
 
50 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.167361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4397  hypothetical protein  56.25 
 
 
43 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0221753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1180  hypothetical protein  55.88 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278308  normal  0.0615222 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0623  hypothetical protein  53.49 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.16233 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2023  hypothetical protein  41.18 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.278774  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1102  protein of unknown function DUF1127  44.44 
 
 
65 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.369678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>