56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2332 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2332  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0375324  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0278  protein of unknown function DUF1007  72.28 
 
 
214 aa  280  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0696628  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1399  protein of unknown function DUF1007  54.59 
 
 
219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0330358  normal  0.0597647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1404  hypothetical protein  50.67 
 
 
225 aa  198  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.384967  normal  0.0196472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1679  protein of unknown function DUF1007  50.22 
 
 
225 aa  194  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355728  normal  0.476153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2246  hypothetical protein  50 
 
 
224 aa  187  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5057  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0941  protein of unknown function DUF1007  45.45 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049615  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4840  hypothetical protein  43.63 
 
 
235 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1352  hypothetical protein  43.81 
 
 
211 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.361884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5736  protein of unknown function DUF1007  45.16 
 
 
221 aa  161  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4544  hypothetical protein  43.52 
 
 
217 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25009  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0392  hypothetical protein  43.66 
 
 
216 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0855106  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0859  hypothetical protein  42.72 
 
 
217 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2906  hypothetical protein  40.47 
 
 
214 aa  153  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0082  hypothetical protein  42.18 
 
 
243 aa  151  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1783  protein of unknown function DUF1007  41.35 
 
 
211 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1043  protein of unknown function DUF1007  44.65 
 
 
218 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3392  protein of unknown function DUF1007  30 
 
 
213 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1660  hypothetical protein  44.3 
 
 
232 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0619256  normal  0.666853 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2203  hypothetical protein  36.11 
 
 
224 aa  101  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0980814  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2774  hypothetical protein  29.11 
 
 
214 aa  95.5  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1754  hypothetical protein  32.55 
 
 
216 aa  94.7  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2375  protein of unknown function DUF1007  32.11 
 
 
221 aa  92.4  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18361 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2975  protein of unknown function DUF1007  34.62 
 
 
223 aa  92  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2712  hypothetical protein  29.41 
 
 
219 aa  88.6  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0089  hypothetical protein  29.65 
 
 
234 aa  88.6  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0097  hypothetical protein  29.65 
 
 
234 aa  88.6  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4248  hypothetical protein  29.85 
 
 
231 aa  85.1  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1095  protein of unknown function DUF1007  31.22 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3691  protein of unknown function DUF1007  28.12 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366003  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3032  hypothetical protein  29.8 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.199492  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3809  hypothetical protein  28.5 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0675  protein of unknown function DUF1007  32.19 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.019732 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3209  hypothetical protein  29.61 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1233  protein of unknown function DUF1007  28.65 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3042  hypothetical protein  29.85 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2752  hypothetical protein  29.09 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2814  hypothetical protein  29.09 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2707  hypothetical protein  29.09 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874677  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2927  hypothetical protein  29.09 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2793  hypothetical protein  28.64 
 
 
209 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3679  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  27.39 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.928215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1163  hypothetical protein  26.17 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000035271  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1271  hypothetical protein  26.17 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00860281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0440  hypothetical protein  26.17 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000354485  hitchhiker  0.00000494731 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2760  protein of unknown function DUF1007  30.15 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0284  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  30 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0329928  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0752  protein of unknown function DUF1007  27.44 
 
 
226 aa  62  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000375765  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1594  polyphosphate kinase  29.79 
 
 
433 aa  61.6  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1975  putative lipoprotein  29.02 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4269  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  29.41 
 
 
224 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1826  normal  0.655735 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3632  hypothetical protein  26.21 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832359  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0115  hypothetical protein  25.64 
 
 
215 aa  46.6  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0287107  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0833  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component related protein  25.79 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279263  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1738  hypothetical protein  23.72 
 
 
212 aa  42.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0927626  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2046  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  25.56 
 
 
169 aa  42.4  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000946986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>