19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1120 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1120  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  684    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0715  hypothetical protein  84.55 
 
 
369 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4665  hypothetical protein  50.67 
 
 
376 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0708  hypothetical protein  45.68 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0697  hypothetical protein  45.68 
 
 
328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0670  hypothetical protein  44.35 
 
 
331 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3048  hypothetical protein  30.26 
 
 
320 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.442334  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2066  hypothetical protein  28.93 
 
 
324 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  29.74 
 
 
361 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1139  hypothetical protein  35.8 
 
 
321 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.888592  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  29.13 
 
 
360 aa  45.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1399  hypothetical protein  34.52 
 
 
320 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.647959  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  31.58 
 
 
377 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1782  hypothetical protein  35.06 
 
 
316 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.368952  normal  0.0393077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  31.15 
 
 
359 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  30.3 
 
 
377 aa  44.3  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  30.88 
 
 
363 aa  42.7  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1947  hypothetical protein  33.33 
 
 
323 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.757191  normal  0.0957628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  28.4 
 
 
375 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0877657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>