24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4216 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4216  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 138 aa  287  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.014913 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1567  hypothetical protein  87.77 
 
 		 140 aa  256  7e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1841  cupin 2, barrel  82.22 
 
 		 141 aa  236  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0498378 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3610  cupin 2 domain-containing protein  78.2 
 
 		 144 aa  225  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4635  cupin 2, barrel  78.2 
 
 		 144 aa  225  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3728  cupin 2 domain-containing protein  78.2 
 
 		 144 aa  225  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0858246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3793  cupin 2 domain-containing protein  78.2 
 
 		 144 aa  225  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.742443  normal  0.0537176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2367  hypothetical protein  77.44 
 
 		 144 aa  223  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  77.7 
 
 		 140 aa  221  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0701  cupin 2 domain-containing protein  72.39 
 
 		 141 aa  214  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  72.18 
 
 		 144 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800776  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2942  hypothetical protein  72.93 
 
 		 144 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2754  cupin 2 domain-containing protein  74.44 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0625  cupin 2 domain-containing protein  66.92 
 
 		 151 aa  184  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1216  cupin 2 domain-containing protein  67.18 
 
 		 145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5282  hypothetical protein  40.16 
 
 		 191 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0505  hypothetical protein  43.31 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.93 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0171538  hitchhiker  0.000000529343 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5798  cupin 2 domain-containing protein  37.21 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1401  hypothetical protein  37.7 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.08 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0939  hypothetical protein  35.14 
 
 		 266 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.85 
 
 		 152 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  28.57 
 
 		 163 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>