30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3151 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3151  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  800    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3083  protein of unknown function DUF201  38.24 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2608  hypothetical protein  37.56 
 
 		 386 aa  187  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0133551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0260  hypothetical protein  29.14 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2432  hypothetical protein  32.27 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6483  hypothetical protein  33.73 
 
 		 407 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5947  hypothetical protein  32.45 
 
 		 393 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095496 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1659  hypothetical protein  33.78 
 
 		 354 aa  137  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.256819  normal  0.444616 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2862  hypothetical protein  29.04 
 
 		 380 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2386  protein of unknown function DUF201  34.04 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2165  protein of unknown function DUF201  31.7 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.292956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5779  hypothetical protein  33.5 
 
 		 384 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0168364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3534  hypothetical protein  30.1 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6003  protein of unknown function DUF201  32.92 
 
 		 376 aa  106  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866607  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1781  protein of unknown function DUF201  31.32 
 
 		 378 aa  104  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1830  hypothetical protein  31.17 
 
 		 374 aa  103  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2022  protein of unknown function DUF201  25.28 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0529  hypothetical protein  34.44 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.865986 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  26.79 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  25.94 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  23.56 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  24.84 
 
 		 360 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0197  hypothetical protein  25.39 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  25.81 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0457  hypothetical protein  25.45 
 
 		 357 aa  50.4  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.764291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6502  hypothetical protein  39.45 
 
 		 357 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.868447  normal  0.0200511 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  30.15 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3069  protein of unknown function DUF201  27.96 
 
 		 330 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  33.9 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1790  hypothetical protein  38.26 
 
 		 318 aa  43.9  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269411  normal  0.659808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>