14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2122 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2122  acyltransferase 3  100 
 
 		 367 aa  693    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4573  acyltransferase 3  46.41 
 
 		 366 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3984  acyltransferase 3  46.31 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487902  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2172  acyltransferase 3  48.13 
 
 		 393 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3370  acyltransferase 3  45.48 
 
 		 370 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.365028  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2295  acyltransferase 3  43.82 
 
 		 387 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.976705  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2806  acyltransferase 3  44.01 
 
 		 387 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.475519 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0178  acyltransferase 3  42.54 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2401  acyltransferase 3  42.34 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3139  acyltransferase 3  46.31 
 
 		 361 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.586381  normal  0.0112196 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0351  acyltransferase 3  34.2 
 
 		 362 aa  169  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0589  acyltransferase 3  42.11 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  23.53 
 
 		 383 aa  46.6  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0644  acyltransferase 3  27.69 
 
 		 397 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>