32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1007 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1007  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  1023    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1676  hypothetical protein  32.92 
 
 		 281 aa  120  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.746938  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1678  hypothetical protein  34.48 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00270694  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1838  hypothetical protein  56.67 
 
 		 142 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1656  hypothetical protein  32.79 
 
 		 309 aa  103  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1839  hypothetical protein  30.08 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1667  hypothetical protein  31.22 
 
 		 373 aa  96.3  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4232  hypothetical protein  30.7 
 
 		 283 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.332018  normal  0.516222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1185  hypothetical protein  27.24 
 
 		 658 aa  88.2  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0534773  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20311  hypothetical protein  24.55 
 
 		 295 aa  87.8  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140019 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2055  hypothetical protein  27.48 
 
 		 384 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2121  hypothetical protein  27.15 
 
 		 384 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.9714  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2275  hypothetical protein  27.15 
 
 		 384 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.969243  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2301  hypothetical protein  27.15 
 
 		 384 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00584965 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1274  hypothetical protein  27.98 
 
 		 658 aa  86.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.367202 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3067  hypothetical protein  28.38 
 
 		 384 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2059  hypothetical protein  27.48 
 
 		 384 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.302728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2307  hypothetical protein  27.15 
 
 		 379 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2385  hypothetical protein  27.03 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481136  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1421  hypothetical protein  30.32 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2258  hypothetical protein  27.93 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1319  hypothetical protein  30.32 
 
 		 301 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0658553  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2530  hypothetical protein  31.56 
 
 		 301 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.235135  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3459  methyltransferase type 11  27.39 
 
 		 866 aa  69.7  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0352711  normal  0.0439165 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2092  Methyltransferase type 11  29.77 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.80059  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2738  methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 561 aa  66.6  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0087  glycosyl transferase  33.03 
 
 		 712 aa  57.4  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  29.29 
 
 		 403 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 643 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2861  hypothetical protein  28.69 
 
 		 192 aa  49.7  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  29.55 
 
 		 309 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0435  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 241 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252383  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>