53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0586 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0586  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  100 
 
 		 69 aa  140  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0349  putative bacterioferritin-associated ferredoxin protein  43.75 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0630258 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2023  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  46 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0797  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  46 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2061  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  46 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0523  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  46 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277187  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0620  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  46 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.40279  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1089  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  46 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1800  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  46 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1933  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  46 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0205  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  40.62 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664847  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0224  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  40.62 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176249 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1259  hypothetical protein  44.44 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1410  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  46 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.0951764 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2115  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03139  hypothetical protein  43.14 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0376  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  43.14 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0376  bacterioferritin-associated ferredoxin  43.14 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.160101  normal  0.665308 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3531  bacterioferritin-associated ferredoxin  43.14 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.495948  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03188  bacterioferritin-associated ferredoxin  43.14 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3050  hypothetical protein  42.03 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4647  bacterioferritin-associated ferredoxin  40.98 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345625  normal  0.0405704 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3713  bacterioferritin-associated ferredoxin  39.34 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0236096  normal  0.567834 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3755  bacterioferritin-associated ferredoxin  39.34 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000454132  decreased coverage  0.000875813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3748  bacterioferritin-associated ferredoxin  39.34 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130142  normal  0.0980641 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3640  bacterioferritin-associated ferredoxin  39.34 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00231672  normal  0.296086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3640  bacterioferritin-associated ferredoxin  39.34 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000341007  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3811  bacterioferritin-associated ferredoxin  39.34 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3807  bacterioferritin-associated ferredoxin  40.98 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107007  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3712  bacterioferritin-associated ferredoxin  40.98 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000134622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3139  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  46 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288105  normal  0.0198862 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3619  bacterioferritin-associated ferredoxin  40.98 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000258442  hitchhiker  0.00460486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2833  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.547055  normal  0.0381011 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1944  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2222  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0309994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5526  bacterioferritin-associated ferredoxin  42 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5880  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  42 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2197  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.781849  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2115  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42 
 
 		 78 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2236  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42 
 
 		 78 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.584581  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3310  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  48 
 
 		 91 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1079  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  44 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0705  bacterioferritin-associated ferredoxin  44 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.901499  normal  0.177306 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3826  bacterioferritin-associated ferredoxin  39.22 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4005  bacterioferritin-associated ferredoxin  39.22 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000574852  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2405  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2775  bacterioferritin-associated ferredoxin  39.68 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000384399  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1443  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  45.45 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0298  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  37.5 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2567  hypothetical protein  44 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0836359  hitchhiker  0.000786438 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3708  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  40.98 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.438328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4621  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384762  hitchhiker  0.000170224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  36 
 
 		 1228 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>