35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14500 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_14500  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  100 
 
 		 188 aa  379  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.111122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9196  protein of unknown function DUF1470  34.83 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4335  hypothetical protein  33.15 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1215  hypothetical protein  33.15 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.759773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1454  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6249  protein of unknown function DUF1470  37.6 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1225  Conserved protein containing a Zn-ribbon-like protein motif possibly RNA-binding  43.08 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00786893 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  28.11 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  27.87 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  35.38 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2691  protein of unknown function DUF1470  27.94 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4308  hypothetical protein  21.2 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6038  hypothetical protein  28.09 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3650  hypothetical protein  33.08 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.242781  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  29.07 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0998  hypothetical protein  21.67 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  29.65 
 
 		 210 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  30.81 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  36.49 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  25.79 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47200  hypothetical protein  26.74 
 
 		 195 aa  44.7  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5144  protein of unknown function DUF1470  30.37 
 
 		 203 aa  44.7  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1036  hypothetical protein  22.04 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26369e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1123  hypothetical protein  21.51 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0952  hypothetical protein  22.04 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0853  hypothetical protein  22.04 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0894  hypothetical protein  22.04 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  26.29 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  27.84 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  29.1 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  32.39 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  27.41 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0139  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.772126  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0870  hypothetical protein  21.51 
 
 		 194 aa  42  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0926819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8261  hypothetical protein  40 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0410012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>