13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05330 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_05330  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  272  9e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0721  cupin 2, barrel  32.38 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.38 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3099  putative signal peptide protein  32.71 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0092  hypothetical protein  31.11 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0310  putative signal peptide protein  33.02 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0170158  normal  0.139977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3382  conserved hypothetical signal peptide protein  30.1 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3035  putative signal peptide protein  30.1 
 
 		 163 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0562  cupin 2, barrel  40.28 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.988265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3937  cupin region  27.35 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674346  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0272  cupin region  26.32 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3547  cupin region  26.21 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2078  hypothetical protein  28.95 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.936672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>