19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02760 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_02760  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  333  3.9999999999999995e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0715  hypothetical protein  47.46 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.100612  normal  0.0883598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4471  hypothetical protein  39.2 
 
 		 155 aa  92  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7022  hypothetical protein  39.31 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0606  competence-like protein  36.84 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.216559  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  36.52 
 
 		 301 aa  71.2  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0108  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.13 
 
 		 420 aa  68.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.94824  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1867  beta-lactamase domain protein  39.22 
 
 		 477 aa  68.9  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0121854 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  36.63 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3773  hypothetical protein  32.23 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  38.54 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  32.35 
 
 		 1931 aa  54.3  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2842  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  39.74 
 
 		 416 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0933431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1905  hypothetical protein  33.33 
 
 		 333 aa  48.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2261  hypothetical protein  31.07 
 
 		 331 aa  47.4  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000590527  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3247  hypothetical protein  39.66 
 
 		 340 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0008  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 		 398 aa  44.3  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.203843  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3047  hypothetical protein  25.96 
 
 		 986 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.845635  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0538  hypothetical protein  22.08 
 
 		 335 aa  41.6  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>