18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4442 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4442  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  615  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3364  hypothetical protein  50.74 
 
 		 339 aa  229  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000469169  normal  0.0159414 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26660  predicted glycosyl transferase  45.38 
 
 		 348 aa  172  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.666341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0722  hypothetical protein  41.67 
 
 		 324 aa  162  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3875  hypothetical protein  39.75 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5106  hypothetical protein  37.13 
 
 		 344 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.126128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1172  hypothetical protein  33.52 
 
 		 357 aa  125  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.669426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1393  hypothetical protein  33.82 
 
 		 349 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.650924  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1231  hypothetical protein  33.91 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0145  hypothetical protein  30.6 
 
 		 382 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.472245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0202  hypothetical protein  30.81 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0286  hypothetical protein  30.77 
 
 		 380 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19760  predicted glycosyl transferase  31.62 
 
 		 363 aa  67  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  35.71 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  37.74 
 
 		 427 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01990  predicted glycosyl transferase  43.08 
 
 		 461 aa  43.5  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  37.5 
 
 		 391 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  35.85 
 
 		 427 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>