20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4415 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4415  HNH nuclease  100 
 
 		 354 aa  698    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.882303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  42.32 
 
 		 354 aa  219  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0932  HNH nuclease  28.17 
 
 		 353 aa  129  6e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.362218  hitchhiker  0.00171926 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2120  HNH nuclease  28.85 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.459779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2106  HNH nuclease  28.85 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.63229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2355  HNH nuclease  29.51 
 
 		 353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.105535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2239  HNH nuclease  28.52 
 
 		 353 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.576011  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4871  HNH nuclease  32.18 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98872 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2264  HNH nuclease  27.41 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4564  HNH nuclease  30.98 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1005  HNH nuclease  27.3 
 
 		 351 aa  110  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1208  HNH nuclease  29.9 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0036  HNH endonuclease  20.49 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000264091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0839  HNH endonuclease  27.43 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.126251  hitchhiker  0.00000000857836 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  28.12 
 
 		 586 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1436  HNH nuclease  37.5 
 
 		 164 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.725628  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  28.66 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  26.57 
 
 		 585 aa  44.3  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0345  hypothetical protein  21.68 
 
 		 372 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.215943  normal  0.281006 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0924  hypothetical protein  39.39 
 
 		 315 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>