31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3798 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3798  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  322  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08750  Protein of unknown function (DUF2505)  35.17 
 
 
164 aa  88.2  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131074  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2830  hypothetical protein  33.75 
 
 
168 aa  87.8  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257591  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1296  proteinase inhibitor I25 cystatin  35.33 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1241  hypothetical protein  35.48 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.630151  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20520  Protein of unknown function (DUF2505)  34.01 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0605599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08430  Protein of unknown function (DUF2505)  32.39 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0652  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196949  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0645  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0665  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160914  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02610  Protein of unknown function (DUF2505)  26.95 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.344177  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6762  hypothetical protein  32.24 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0780  Protein of unknown function DUF2505  29.51 
 
 
169 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576817  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2398  Protein of unknown function DUF2505  31.76 
 
 
171 aa  60.5  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0024135 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05540  hypothetical protein  30.77 
 
 
175 aa  57.8  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0779  Protein of unknown function DUF2505  22.7 
 
 
166 aa  57  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.242967  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3116  hypothetical protein  32.73 
 
 
171 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.02824  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4964  hypothetical protein  28.31 
 
 
164 aa  54.7  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0822  hypothetical protein  25.6 
 
 
168 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1815  Protein of unknown function DUF2505  29.87 
 
 
394 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553226  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2822  hypothetical protein  27.44 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0091  hypothetical protein  26.9 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2849  hypothetical protein  27.44 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2866  hypothetical protein  27.44 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1883  hypothetical protein  34.96 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.960325 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3647  Protein of unknown function DUF2505  25.14 
 
 
178 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2610  hypothetical protein  33.96 
 
 
170 aa  47.8  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.122572  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10489  hypothetical protein  27.06 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.224481  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1223  hypothetical protein  27.54 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3648  Protein of unknown function DUF2505  26.5 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3383  hypothetical protein  25.9 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>