43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2390 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2390  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 		 249 aa  495  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1291  hypothetical protein  37.01 
 
 		 141 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  28.57 
 
 		 139 aa  53.1  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  31.37 
 
 		 129 aa  51.6  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  28.04 
 
 		 131 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0716  cytidine deaminase  36.14 
 
 		 142 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4270  hypothetical protein  33.86 
 
 		 141 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.372249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  29.41 
 
 		 133 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  32.67 
 
 		 132 aa  48.1  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  32.67 
 
 		 127 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  30.48 
 
 		 134 aa  48.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  32.35 
 
 		 132 aa  47.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6907  hypothetical protein  34.65 
 
 		 139 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4804  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  33.96 
 
 		 129 aa  46.6  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 388 aa  46.2  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  27.62 
 
 		 142 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  31.68 
 
 		 131 aa  45.8  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  30.08 
 
 		 133 aa  45.8  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  31.93 
 
 		 142 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1065  cytidine deaminase  29.57 
 
 		 135 aa  45.4  0.0009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.805536  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  29.7 
 
 		 132 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  31.68 
 
 		 132 aa  43.9  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 131 aa  44.3  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  27.36 
 
 		 132 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4168  hypothetical protein  32.54 
 
 		 142 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  31.43 
 
 		 131 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1316  cytidine deaminase  30.83 
 
 		 145 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.501646 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  31.13 
 
 		 138 aa  42.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4191  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.4 
 
 		 147 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04930  cytidine deaminase  34.65 
 
 		 143 aa  42  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4051  cytidine deaminase  33.82 
 
 		 151 aa  42  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  30.69 
 
 		 131 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  30.69 
 
 		 131 aa  42  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  30.69 
 
 		 131 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  30.69 
 
 		 131 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  28.57 
 
 		 127 aa  42  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  30.69 
 
 		 131 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  30.69 
 
 		 131 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  30.69 
 
 		 131 aa  42.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  30.69 
 
 		 131 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  30.48 
 
 		 131 aa  42  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0886  hypothetical protein  25 
 
 		 197 aa  42  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>