18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1421 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1421  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  371  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0767187  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1490  DivIVA domain repeat protein  42.61 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1389  hypothetical protein  40.34 
 
 
194 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000191938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2501  hypothetical protein  38.76 
 
 
183 aa  100  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.683397  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1372  hypothetical protein  38.12 
 
 
194 aa  98.6  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868924  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1186  hypothetical protein  38.42 
 
 
184 aa  97.1  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1010  hypothetical protein  37.36 
 
 
179 aa  92.4  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10190  hypothetical protein  35.43 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.575599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23550  hypothetical protein  41.9 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.186469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2585  hypothetical protein  31.25 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.44653  normal  0.13384 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0114  hypothetical protein  26.18 
 
 
567 aa  58.2  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.391457  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2754  hypothetical protein  32.24 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32400  DivIVA protein  51.56 
 
 
99 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.472474  normal  0.56982 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0449  DivIVA domain repeat protein  25.26 
 
 
503 aa  55.1  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.148469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0651  hypothetical protein  51.72 
 
 
631 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0791  DivIVA domain protein  38.57 
 
 
136 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1328  hypothetical protein  41.1 
 
 
425 aa  42.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34440  hypothetical protein  39.76 
 
 
87 aa  41.6  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0738844  normal  0.536737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>