39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1160 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1160  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  525  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.582536  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0767  hypothetical protein  55.56 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2912  hypothetical protein  59.52 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0702  hypothetical protein  46.36 
 
 		 295 aa  186  4e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27820  hypothetical protein  53.72 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0806  hypothetical protein  58.23 
 
 		 179 aa  175  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2509  hypothetical protein  47.4 
 
 		 328 aa  171  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000693583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2789  hypothetical protein  54.79 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2482  hypothetical protein  57.24 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.012965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3998  hypothetical protein  54.48 
 
 		 175 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4058  hypothetical protein  54.48 
 
 		 175 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3984  hypothetical protein  54.48 
 
 		 175 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1196  hypothetical protein  55.17 
 
 		 170 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11259  hypothetical protein  53.79 
 
 		 175 aa  156  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139223 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2211  hypothetical protein  53.79 
 
 		 175 aa  155  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.451727  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06480  hypothetical protein  54 
 
 		 172 aa  155  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4485  hypothetical protein  53.1 
 
 		 186 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0190167  normal  0.0355281 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1734  hypothetical protein  49.04 
 
 		 192 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4334  hypothetical protein  48.61 
 
 		 167 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09530  hypothetical protein  52.74 
 
 		 173 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.243649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1749  hypothetical protein  45.86 
 
 		 195 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2161  hypothetical protein  53.64 
 
 		 169 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1865  hypothetical protein  52.74 
 
 		 162 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4021  hypothetical protein  52.74 
 
 		 170 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.143522  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23860  hypothetical protein  39.89 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1678  hypothetical protein  49.67 
 
 		 169 aa  119  6e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000541332 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19360  hypothetical protein  48.53 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.494262  normal  0.0151138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7163  hypothetical protein  39.53 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0827  transmembrane protein  50.99 
 
 		 157 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0490  hypothetical protein  44.81 
 
 		 163 aa  108  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5256  hypothetical protein  43.87 
 
 		 160 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15320  hypothetical protein  37.5 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1264  hypothetical protein  46.21 
 
 		 194 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  44.6 
 
 		 154 aa  99  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0644  hypothetical protein  48.89 
 
 		 185 aa  95.9  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.822743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4432  hypothetical protein  41.33 
 
 		 167 aa  94.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00660  hypothetical protein  43.15 
 
 		 175 aa  89  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3166  hypothetical protein  34.46 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.861461  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0637  hypothetical protein  34.78 
 
 		 568 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>