13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_R0025 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_R0025    100 
 
 		 370 bp  733    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0019    89.66 
 
 		 368 bp  101  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.70554  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0069    84.62 
 
 		 369 bp  63.9  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342844  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_tm0001    94.44 
 
 		 397 bp  56  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.184548  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07640    80.8 
 
 		 371 bp  56  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.755411  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0046    85.14 
 
 		 370 bp  52  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.6957  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0021    96.55 
 
 		 368 bp  50.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1398    91.89 
 
 		 397 bp  50.1  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0018    88.89 
 
 		 366 bp  50.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0050  tmRNA  86.54 
 
 		 365 bp  48.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.720301 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0026    93.55 
 
 		 361 bp  46.1  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.918941 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20280    86.27 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.901931  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0052  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>