22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0874 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0874  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  547  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1638  hypothetical protein  88.7 
 
 
267 aa  373  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0257299 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0868  hypothetical protein  77.25 
 
 
141 aa  204  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0872  hypothetical protein  85.29 
 
 
123 aa  182  5.0000000000000004e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1619  hypothetical protein  62.75 
 
 
275 aa  175  7e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.631243  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0808  hypothetical protein  37.57 
 
 
300 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3307  hypothetical protein  38.62 
 
 
287 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3319  hypothetical protein  36.55 
 
 
290 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12060  hypothetical protein  36.73 
 
 
349 aa  95.5  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3219  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00235005  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4384  hypothetical protein  41.73 
 
 
307 aa  82  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1535  hypothetical protein  31.06 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1537  hypothetical protein  31.06 
 
 
302 aa  75.5  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10630  hypothetical protein  42.22 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00481692  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0877  hypothetical protein  29.67 
 
 
269 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4053  hypothetical protein  25.66 
 
 
266 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1511  hypothetical protein  25.15 
 
 
264 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0987  hypothetical protein  27.97 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000176553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0781  hypothetical protein  28.24 
 
 
290 aa  52.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0308662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1756  hypothetical protein  36.26 
 
 
298 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00985833  hitchhiker  0.000872746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01640  hypothetical protein  27.85 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.298419  normal  0.6279 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3155  hypothetical protein  36 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.596413  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>