More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0208 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0208  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 		 333 aa  689    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  89.73 
 
 		 332 aa  619  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.986731 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1412  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  84.08 
 
 		 333 aa  585  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1130  Luciferase-like monooxygenase  82.73 
 
 		 332 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2587  Luciferase-like monooxygenase  82.73 
 
 		 332 aa  573  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5308  Luciferase-like monooxygenase  72.97 
 
 		 329 aa  515  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  68.58 
 
 		 329 aa  492  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  61.16 
 
 		 334 aa  440  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  59.33 
 
 		 335 aa  424  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  60.24 
 
 		 332 aa  418  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3981  luciferase family protein  63.75 
 
 		 329 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0510411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1140  luciferase family protein  64.13 
 
 		 332 aa  415  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0670  Luciferase-like monooxygenase  40.12 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4037  putative dehydrogenase protein  44.38 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7870  putative dehydrogenase protein  40.55 
 
 		 318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4597  putative dehydrogenase protein  41.52 
 
 		 329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4685  putative dehydrogenase protein  41.52 
 
 		 329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348286  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4980  putative dehydrogenase protein  41.52 
 
 		 329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4087  putative dehydrogenase protein  39.63 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1142  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  37.7 
 
 		 318 aa  226  4e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5283  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  37.61 
 
 		 326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3301  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  37.39 
 
 		 318 aa  219  7e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2231  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.64 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3081  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  38.91 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.903709  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3722  putative dehydrogenase protein  40.73 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0414555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5026  Luciferase-like monooxygenase  40.55 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.798611  normal  0.182445 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0420  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase  35.65 
 
 		 342 aa  216  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3709  Luciferase-like monooxygenase  39.34 
 
 		 325 aa  215  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1188  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  35.45 
 
 		 318 aa  212  7e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8019  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  34.85 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  34.62 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0743  luciferase family protein  36.23 
 
 		 320 aa  210  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.94 
 
 		 339 aa  209  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  34.32 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1669  hypothetical protein  35.98 
 
 		 321 aa  205  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0484  luciferase-like protein  33.94 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.573719  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  34.02 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  34.02 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  34.02 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  34.02 
 
 		 336 aa  202  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5600  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  35.45 
 
 		 321 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7147  Luciferase-like monooxygenase  40.25 
 
 		 343 aa  202  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348721  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5578  putative dehydrogenase protein  36.17 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  33.83 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4853  Luciferase-like monooxygenase  37.27 
 
 		 321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00131867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4387  Luciferase-like, subgroup  35.4 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.128943  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6346  luciferase family protein  39.63 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310691  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0326  Luciferase-like monooxygenase  33.54 
 
 		 325 aa  196  6e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1366  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.28 
 
 		 321 aa  196  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3763  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  34.62 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3627  dehydrogenase  36.25 
 
 		 319 aa  193  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3201  luciferase-like protein  34.56 
 
 		 320 aa  192  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4584  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  35.17 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1273  putative dehydrogenase protein  35.78 
 
 		 320 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  34.23 
 
 		 336 aa  189  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1275  putative dehydrogenase protein  37.92 
 
 		 320 aa  188  9e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4148  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.23 
 
 		 331 aa  188  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3224  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  37.7 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000991835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4866  Luciferase-like monooxygenase  33.13 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00773357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  35.14 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4126  luciferase family protein  35.82 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.04 
 
 		 342 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  31.74 
 
 		 322 aa  185  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1435  putative dehydrogenase protein  37.31 
 
 		 320 aa  185  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3680  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  32.02 
 
 		 322 aa  182  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4851  Luciferase-like monooxygenase  34.94 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0116346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4944  luciferase family protein  36.14 
 
 		 330 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4855  luciferase-like protein  36.14 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5223  luciferase family protein  36.14 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.018076 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4102  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  35.61 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  0.155147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2747  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  35.67 
 
 		 321 aa  175  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5098  Luciferase-like monooxygenase  35.44 
 
 		 379 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5448  luciferase family protein  33.94 
 
 		 328 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5802  putative dehydrogenase protein  32.24 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1341  luciferase family protein  34.6 
 
 		 328 aa  169  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.973005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18990  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.24 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.873493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3215  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.49 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.912024  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0783  luciferase family protein  33.23 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0447629  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0922  luciferase family protein  32.45 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0382  luciferase-like monooxygenase  32.02 
 
 		 320 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2479  Luciferase-like monooxygenase  34.38 
 
 		 331 aa  159  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000324346  hitchhiker  0.00415555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6790  luciferase family protein  34.66 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1586  luciferase family protein  31.33 
 
 		 503 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.648959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  33.03 
 
 		 360 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1544  luciferase family protein  31.02 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708084  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0280  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  39.11 
 
 		 260 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2078  hypothetical protein  46.88 
 
 		 287 aa  96.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961644  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  25.55 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.44 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  25.55 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  25.55 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  28.31 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  30.53 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.67 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  34.86 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1944  luciferase family protein  34.86 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  23.34 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  34.86 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.121493 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0202  Luciferase-like monooxygenase  23.91 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>