66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_R0047 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_R0047  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.906492 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6017  5SrRNA  90.43 
 
 		 118 bp  141  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6010  5SrRNA  90.43 
 
 		 118 bp  141  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.810803 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0067  5S ribosomal RNA  87.83 
 
 		 115 bp  117  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.360556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0006  5S ribosomal RNA  87.83 
 
 		 115 bp  117  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0364789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0075  5S ribosomal RNA  87.83 
 
 		 115 bp  117  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00798302  normal  0.222372 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0055  5S ribosomal RNA  87.83 
 
 		 115 bp  117  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.831714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0082  5S ribosomal RNA  87.83 
 
 		 115 bp  117  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0052  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 118 bp  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.678773 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0059  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 118 bp  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.556959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_R0067  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 118 bp  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.874894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0040  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 118 bp  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.498325 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4357  5S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 115 bp  99.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4293  5S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 115 bp  99.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0067  5S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 118 bp  99.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0061  5S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 118 bp  99.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0054  5S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 118 bp  99.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0006  5S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 118 bp  99.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.545008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_r3  5S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 122 bp  99.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0359227  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0039  5S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 122 bp  99.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320086  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_r01  5S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 118 bp  99.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0006  5S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 122 bp  99.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0039  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  81.8  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0021  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  81.8  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0060  5S ribosomal RNA  91.84 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0042  5S ribosomal RNA  91.84 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0022  5S ribosomal RNA  91.84 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0008  5S ribosomal RNA  91.84 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0026  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.255139  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0026  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 128 bp  61.9  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0065  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0029  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0024  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0013  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000464896  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0018  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.295513  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0023  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0031  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0953498  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0062  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0031  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0107699  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0058  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000489313  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0061  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0013  5S ribosomal RNA  96.3 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0618011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0027  5S ribosomal RNA  96.3 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360256  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0004  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.577607  decreased coverage  0.00000414863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0012  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0078  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245151  normal  0.151897 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0029  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.257229  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0071  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100588 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0047  5S ribosomal RNA  88 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0124102  hitchhiker  0.00149945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0044  5S ribosomal RNA  88 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000702474  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21630  5S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 164 bp  46.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13570  5S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 164 bp  46.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.053497  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04520  5S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 164 bp  46.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.342927  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4506  5S ribosomal RNA  83.1 
 
 		 119 bp  46.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4503  5S ribosomal RNA  83.1 
 
 		 119 bp  46.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6506  5S ribosomal RNA  83.1 
 
 		 119 bp  46.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6503  5S ribosomal RNA  83.1 
 
 		 119 bp  46.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0058  5S ribosomal RNA  83.1 
 
 		 114 bp  46.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0046  5S ribosomal RNA  83.1 
 
 		 114 bp  46.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0037  5S ribosomal RNA  83.1 
 
 		 114 bp  46.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.10728 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0006  5S ribosomal RNA  82.05 
 
 		 114 bp  44.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0003  5S ribosomal RNA  82.05 
 
 		 114 bp  44.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>