15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_R0004 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_R0004  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.577607  decreased coverage  0.00000414863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0012  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0029  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.257229  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0071  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100588 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0078  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245151  normal  0.151897 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0023  5S ribosomal RNA  89.87 
 
 		 116 bp  93.7  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.881601  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0042  5S ribosomal RNA  89.87 
 
 		 116 bp  93.7  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.1617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0047  5S ribosomal RNA  89.87 
 
 		 116 bp  93.7  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0065  5S ribosomal RNA  89.87 
 
 		 116 bp  93.7  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0047  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.906492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0005  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.52738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0016  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0006  5S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.449414  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0030  5S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.476449  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0042  5S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>