27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1480 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1480  trimethylamine methyltransferase  100 
 
 
504 aa  1038    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.246816  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5110  trimethylamine methyltransferase  40.29 
 
 
511 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148591  normal  0.0268 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3128  trimethylamine methyltransferase  40.46 
 
 
519 aa  340  4e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2171  trimethylamine methyltransferase  40.17 
 
 
519 aa  335  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2817  trimethylamine methyltransferase  40.21 
 
 
519 aa  325  9e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.322933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2813  putative trimethylamine methyltransferase protein  35.35 
 
 
513 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.94532  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1485  trimethylamine methyltransferase  35.35 
 
 
513 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1716  trimethylamine methyltransferase  35.35 
 
 
513 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1586  trimethylamine methyltransferase  35.66 
 
 
515 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.091176 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1374  trimethylamine methyltransferase  34.57 
 
 
514 aa  257  4e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.561281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2223  trimethylamine methyltransferase  33.82 
 
 
519 aa  253  7e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727835  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1775  trimethylamine methyltransferase  35.03 
 
 
523 aa  250  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.445746  normal  0.0169643 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4326  trimethylamine methyltransferase  31.37 
 
 
476 aa  247  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0432  trimethylamine methyltransferase  33.47 
 
 
514 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1728  trimethylamine methyltransferase  31.67 
 
 
468 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4008  trimethylamine methyltransferase MttB-like protein  31.81 
 
 
517 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4870  trimethylamine methyltransferase  27.62 
 
 
471 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1730  trimethylamine methyltransferase  29.83 
 
 
476 aa  179  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1111  trimethylamine methyltransferase  26.71 
 
 
477 aa  146  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1467  trimethylamine methyltransferase  28.14 
 
 
475 aa  141  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.657417  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2313  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  23.43 
 
 
484 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0209756  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1601  trimethylamine methyltransferase  22.54 
 
 
510 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.38036  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2196  trimethylamine methyltransferase  25.68 
 
 
515 aa  96.7  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  0.0249969 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2308  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  23.57 
 
 
334 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0038557  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1106  trimethylamine:corrinoid methyltransferase-like protein  21.35 
 
 
417 aa  60.5  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.491742  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1109  trimethylamine:corrinoid methyltransferase-like protein  24.46 
 
 
410 aa  60.1  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2309  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  27.82 
 
 
147 aa  56.2  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00021948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>