23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_R0042 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_R0042  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.835093  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0048  tRNA-Glu  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.200275 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0011  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0580345  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0048  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0046  tRNA-Glu  90 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0050  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.259835 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0040  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0015  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0154523  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0019  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0046  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0007  tRNA-Glu  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0034  tRNA-Glu  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0042  tRNA-Glu  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.81664 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0016  tRNA-Glu  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0045  tRNA-Glu  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.556682  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0019  tRNA-Glu  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0067  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.772676  normal  0.0107371 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0030  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0016  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0043  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0010  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0068  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.544619  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0658061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>