11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_R0011 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_R0011  tRNA-Glu  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0580345  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0048  tRNA-Glu  97.33 
 
 
75 bp  133  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0048  tRNA-Glu  94.67 
 
 
75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.200275 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0042  tRNA-Glu  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.835093  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0050  tRNA-Glu  89.71 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.259835 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0040  tRNA-Glu  90 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0015  tRNA-Glu  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0154523  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0019  tRNA-Glu  96.43 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0046  tRNA-Glu  96.43 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0046  tRNA-Glu  85 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0043  tRNA-Glu  96.43 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>