14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1955 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1955  30S ribosomal protein S27ae  100 
 
 		 44 aa  94.7  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3054  Ribosomal protein S27a  77.27 
 
 		 44 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1272  Ribosomal protein S27a  75 
 
 		 44 aa  75.5  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122795  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1172  Ribosomal protein S27a  72.73 
 
 		 44 aa  74.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1325  ribosomal protein S27a  50 
 
 		 49 aa  48.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2284  30S ribosomal protein S27ae  45.83 
 
 		 49 aa  44.7  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000131146  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0654  SSU ribosomal protein S27AE  46.81 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.663989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0241  ribosomal protein S27a  43.18 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.834895 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0564  Ribosomal protein S27a  45.83 
 
 		 50 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0281  30S ribosomal protein S27ae  42.86 
 
 		 49 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2246  ribosomal protein S27a  45.83 
 
 		 51 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2867  ribosomal protein S27a  38.64 
 
 		 62 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0599  Ribosomal protein S27a  48.48 
 
 		 51 aa  40.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0284  ribosomal protein S27a  41.3 
 
 		 57 aa  40  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.473204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>