11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_R0019 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  167  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0046  tRNA-Leu  95.24 
 
 
84 bp  135  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0027  tRNA-Leu  91.76 
 
 
85 bp  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.319132  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  87.06 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0049  tRNA-Leu  85.71 
 
 
84 bp  71.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.256448  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0044  tRNA-Leu  85.71 
 
 
84 bp  71.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0016  tRNA-Leu  88.06 
 
 
83 bp  69.9  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.454165  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0054  tRNA-Leu  84.52 
 
 
84 bp  63.9  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0037  tRNA-Leu  89.36 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0014  tRNA-Leu  89.36 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0021  tRNA-Leu  89.74 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.283628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>