20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4898 on replicon NC_013746
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_3914  Integrase catalytic region  88.81 
 
 
678 bp  728    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.835776  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4047  Integrase catalytic region  91.38 
 
 
678 bp  858    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4966  Integrase catalytic region  92.27 
 
 
678 bp  906    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4898    100 
 
 
678 bp  1344    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.198767  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4863  Integrase catalytic region  89.4 
 
 
678 bp  759    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4099    82.69 
 
 
663 bp  410  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4676    82.22 
 
 
674 bp  379  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4506    83.97 
 
 
454 bp  299  5e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2685    82.26 
 
 
642 bp  252  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00531158  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4889    81.82 
 
 
728 bp  244  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.163217  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4512    88.79 
 
 
518 bp  238  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3224  transposase  78.97 
 
 
681 bp  153  8e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3181    80.26 
 
 
681 bp  147  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3184    79.74 
 
 
681 bp  131  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.981757  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0138    93.85 
 
 
235 bp  97.6  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128048  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4083    82.58 
 
 
180 bp  93.7  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4959  Transposase and inactivated derivatives-like protein  83.74 
 
 
600 bp  85.7  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0858  transposase  95.12 
 
 
681 bp  65.9  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4126    83.95 
 
 
680 bp  58  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0142    96.88 
 
 
690 bp  56  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0709902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>