25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4889 on replicon NC_013746
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013746  Htur_4889    100 
 
 
728 bp  1443    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.163217  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4676    87.14 
 
 
674 bp  434  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4966  Integrase catalytic region  85.37 
 
 
678 bp  371  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4512    89.66 
 
 
518 bp  371  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4863  Integrase catalytic region  84.92 
 
 
678 bp  355  1e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3914  Integrase catalytic region  83.81 
 
 
678 bp  315  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.835776  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4047  Integrase catalytic region  83.81 
 
 
678 bp  315  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4898    81.82 
 
 
678 bp  244  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.198767  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4099    82.92 
 
 
663 bp  214  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4506    82.61 
 
 
454 bp  178  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3224  transposase  83.04 
 
 
681 bp  143  7.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3184    83.04 
 
 
681 bp  127  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.981757  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3181    83.04 
 
 
681 bp  127  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2685    82.13 
 
 
642 bp  125  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00531158  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4769  hypothetical protein  84.77 
 
 
156 bp  109  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0138    91.67 
 
 
235 bp  95.6  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128048  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4099    87.5 
 
 
631 bp  87.7  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4083    84.03 
 
 
180 bp  85.7  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4959  Transposase and inactivated derivatives-like protein  80.98 
 
 
600 bp  81.8  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4899    83.9 
 
 
127 bp  67.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.33699  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4126    82.73 
 
 
680 bp  67.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4200    92.5 
 
 
427 bp  56  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0858  transposase  79.11 
 
 
681 bp  52  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0142    100 
 
 
690 bp  48.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0709902  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4808    96.43 
 
 
159 bp  48.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>