19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4512 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4512    100 
 
 
518 bp  1027    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4863  Integrase catalytic region  95.24 
 
 
678 bp  371  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4889    89.66 
 
 
728 bp  371  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.163217  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4047  Integrase catalytic region  92.89 
 
 
678 bp  319  4e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4966  Integrase catalytic region  92.89 
 
 
678 bp  319  4e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3914  Integrase catalytic region  92.21 
 
 
678 bp  315  6.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.835776  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4898    88.79 
 
 
678 bp  238  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.198767  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4676    86.4 
 
 
674 bp  198  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4099    86.36 
 
 
663 bp  190  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4506    87.19 
 
 
454 bp  188  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2685    82.32 
 
 
642 bp  172  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00531158  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3184    82.53 
 
 
681 bp  137  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.981757  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3181    82.53 
 
 
681 bp  137  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3224  transposase  85.19 
 
 
681 bp  131  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0138    94.29 
 
 
235 bp  107  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128048  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4099    89.77 
 
 
631 bp  103  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4959  Transposase and inactivated derivatives-like protein  82.76 
 
 
600 bp  89.7  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1644    92.31 
 
 
992 bp  54  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1694  Tryptophan--tRNA ligase  90 
 
 
1713 bp  48.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>