18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4099 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4099    100 
 
 
663 bp  1314    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4863  Integrase catalytic region  85.93 
 
 
678 bp  573  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4966  Integrase catalytic region  85.33 
 
 
678 bp  551  1e-155  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3914  Integrase catalytic region  84.88 
 
 
678 bp  527  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.835776  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4047  Integrase catalytic region  84.88 
 
 
678 bp  527  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4898    82.69 
 
 
678 bp  410  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.198767  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4676    80.21 
 
 
674 bp  287  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4889    82.92 
 
 
728 bp  214  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.163217  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4506    80.63 
 
 
454 bp  200  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4512    86.36 
 
 
518 bp  190  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2685    86.23 
 
 
642 bp  123  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00531158  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3224  transposase  84.55 
 
 
681 bp  83.8  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0138    90.77 
 
 
235 bp  81.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128048  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4083    85.39 
 
 
180 bp  73.8  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4899    86.89 
 
 
127 bp  58  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.33699  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3181    82.8 
 
 
681 bp  58  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3184    82.8 
 
 
681 bp  58  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.981757  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4959  Transposase and inactivated derivatives-like protein  86.54 
 
 
600 bp  48.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>