35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2268 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2268  putative metal cation transporter  100 
 
 
301 aa  581  1.0000000000000001e-165  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0303  zinc transporter  64.95 
 
 
321 aa  368  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402081  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4007  putative metal cation transporter  39.78 
 
 
416 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1130  putative metal cation transporter  34.51 
 
 
392 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.318417 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1662  putative metal cation transporter  32.27 
 
 
392 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2512  putative metal cation transporter  32.26 
 
 
402 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0162698  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0084  putative metal cation transporter  36.14 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204123  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4420  zinc/iron permease  30.59 
 
 
409 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3970  putative metal cation transporter  33.88 
 
 
403 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.750927 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2573  putative metal cation transporter  29.69 
 
 
416 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4421  putative metal cation transporter  34.63 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5000  putative metal cation transporter  41.03 
 
 
280 aa  62.4  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1350  ZIP family zinc transporter  31.5 
 
 
283 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.234578 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0605  zinc/iron permease  33.1 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.073996  normal  0.0988695 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1201  ZIP family zinc transporter  32.07 
 
 
272 aa  59.3  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0954273  normal  0.723044 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0974  hypothetical protein  27.55 
 
 
244 aa  58.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.22438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2368  zinc/iron permease  34.4 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.393173 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  28.29 
 
 
261 aa  55.8  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1983  ZIP family zinc transporter  35.45 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.731649  normal  0.881196 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0814  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 
253 aa  52.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  27.39 
 
 
244 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  28.99 
 
 
273 aa  47  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  27.54 
 
 
262 aa  47  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  22.96 
 
 
255 aa  46.2  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  25.71 
 
 
258 aa  46.2  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  32.97 
 
 
262 aa  45.8  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  29.25 
 
 
279 aa  45.8  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  26.06 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  22.67 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  27.17 
 
 
270 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19330  predicted divalent heavy-metal cations transporter  35.06 
 
 
242 aa  44.3  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048073 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  27.19 
 
 
247 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  31.58 
 
 
258 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  25.32 
 
 
300 aa  43.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  28.57 
 
 
264 aa  42.7  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>