32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_19200 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_19200  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  100 
 
 
321 aa  657    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.203382  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2342  bifunctional deaminase-reductase-like  29.39 
 
 
295 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0699059  normal  0.0703576 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1181  bifunctional deaminase-reductase-like  26.46 
 
 
283 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2352  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.31 
 
 
226 aa  60.8  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000292677  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4689  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.07 
 
 
250 aa  60.1  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.192028  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0937  2, 5-diamino-6-(5-phosphoribosylamino)pyrimidin-4(3H)-one reductase  27.11 
 
 
225 aa  57  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0807982 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1313  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  25.19 
 
 
231 aa  55.8  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2228  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0584067  normal  0.0428957 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2026  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  26.67 
 
 
226 aa  53.5  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1683  deaminase-reductase domain-containing protein  28.22 
 
 
231 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.137585  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2570  deaminase-reductase domain-containing protein  24.89 
 
 
230 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000741328 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0604  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  25.78 
 
 
222 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16600  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  24.72 
 
 
289 aa  50.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2575  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  24.34 
 
 
225 aa  49.7  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2558  deaminase-reductase domain-containing protein  27.63 
 
 
229 aa  49.3  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.4121  normal  0.303057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0489  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  25.33 
 
 
232 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1555  hypothetical protein  31.11 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4278  riboflavin biosynthesis protein RibD  27.59 
 
 
383 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23466  normal  0.0329516 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12686  hypothetical protein  23.38 
 
 
258 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000115861  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0226  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  27.68 
 
 
221 aa  47.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000414817  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4752  hypothetical protein  26.46 
 
 
234 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0498  riboflavin biosynthesis protein RibD  24 
 
 
362 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0804  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  25.33 
 
 
226 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.301306  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0319  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.45 
 
 
230 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2639  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.52 
 
 
409 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.143151  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1345  hypothetical protein  24.32 
 
 
273 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0996  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.51 
 
 
241 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0770  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.45 
 
 
234 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1500  hypothetical protein  29.63 
 
 
248 aa  43.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0659  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  24.92 
 
 
357 aa  43.1  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2094  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.04 
 
 
234 aa  43.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0869  riboflavin biosynthesis protein RibD  26.98 
 
 
375 aa  42.7  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00417568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>