38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5808 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5808  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
356 aa  706    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451965  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0868  hypothetical protein  32.25 
 
 
365 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.877924  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0339  aminoglycoside phosphotransferase  28.65 
 
 
358 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0367  aminoglycoside phosphotransferase  29.86 
 
 
356 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0358  aminoglycoside phosphotransferase  31.1 
 
 
354 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0366  aminoglycoside phosphotransferase  30.81 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0363  aminoglycoside phosphotransferase  30.81 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0356  aminoglycoside phosphotransferase  30.81 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0269  hypothetical protein  33.05 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3627  aminoglycoside phosphotransferase  29.12 
 
 
365 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0655  hypothetical protein  26.63 
 
 
361 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7005  aminoglycoside phosphotransferase  28.86 
 
 
348 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000158499  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0364  hypothetical protein  29.41 
 
 
346 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3874  aminoglycoside phosphotransferase  29.89 
 
 
355 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07491  hypothetical protein  26.61 
 
 
384 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.193823  normal  0.063089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1142  aminoglycoside phosphotransferase  28.37 
 
 
372 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655934  normal  0.0113624 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3807  aminoglycoside phosphotransferase  29.88 
 
 
354 aa  103  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3610  aminoglycoside phosphotransferase  29.79 
 
 
354 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0333  aminoglycoside phosphotransferase  29.79 
 
 
354 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.320004 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1795  hypothetical protein  28.81 
 
 
376 aa  102  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156742  normal  0.0804022 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4578  aminoglycoside phosphotransferase  29.5 
 
 
355 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000313167 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1766  putative homoserine kinase type II  28.61 
 
 
359 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0729  aminoglycoside phosphotransferase  28.41 
 
 
385 aa  97.8  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.272999 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1410  MdsC protein  23.86 
 
 
368 aa  96.3  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.280569  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3494  aminoglycoside phosphotransferase  29.97 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.794585 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2269  aminoglycoside phosphotransferase  24.21 
 
 
352 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.788221  normal  0.0258017 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3260  aminoglycoside phosphotransferase  28.38 
 
 
382 aa  94  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0860  hypothetical protein  25.86 
 
 
372 aa  92.8  8e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.350344  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3431  aminoglycoside phosphotransferase  28.61 
 
 
402 aa  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13281  hypothetical protein  27.22 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2100  aminoglycoside phosphotransferase  27.68 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.624576  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0081  hypothetical protein  23.77 
 
 
387 aa  86.3  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.201712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0570  hypothetical protein  25.14 
 
 
370 aa  82  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0030  hypothetical protein  25.86 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.549525 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1518  aminoglycoside phosphotransferase  23.65 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.215036  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07051  hypothetical protein  29.35 
 
 
273 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1086  homoserine kinase  30.73 
 
 
328 aa  47  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3215  aminoglycoside phosphotransferase  27.82 
 
 
355 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>