61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4722 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4722  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 165 aa  338  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.992615  normal  0.959626 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3328  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580011  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3472  type IV pilus assembly PilZ  49.21 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314761  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3408  type IV pilus assembly PilZ  49.21 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0420248  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3392  type IV pilus assembly PilZ  47.62 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1523  2-alkenal reductase  37.84 
 
 		 759 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5122  type IV pilus assembly PilZ  31.2 
 
 		 843 aa  62.4  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0427193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2350  DnaK family protein  36.52 
 
 		 782 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.646727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1598  type IV pilus assembly PilZ  34.51 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1614  2-alkenal reductase  36.52 
 
 		 779 aa  61.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1519  2-alkenal reductase  36.52 
 
 		 778 aa  61.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1503  type IV pilus assembly PilZ  34.51 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6446  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  30.36 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4589  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  29.75 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.527063  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2361  hypothetical protein  32.48 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1964  response regulator CheY  29.82 
 
 		 244 aa  57.8  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0118313  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1508  type IV pilus assembly PilZ  30.51 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4345  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  27.7 
 
 		 487 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0926285  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3745  response regulator receiver domain-containing protein  32.04 
 
 		 280 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2331  2-alkenal reductase  29.73 
 
 		 778 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0761037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2419  2-alkenal reductase  29.73 
 
 		 771 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0536577  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4213  response regulator receiver domain-containing protein  27.03 
 
 		 487 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.871258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3886  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  31.58 
 
 		 279 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.267339  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4368  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  27.03 
 
 		 487 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3802  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  31.58 
 
 		 279 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0707641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1622  type IV pilus assembly PilZ  25.89 
 
 		 112 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3501  type IV pilus assembly PilZ  30.3 
 
 		 185 aa  48.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.424652 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3098  hypothetical protein  36.47 
 
 		 135 aa  47.4  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000872155  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1498  type IV pilus assembly PilZ  27.42 
 
 		 123 aa  47.8  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.133421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1541  type IV pilus assembly protein PilZ  31.19 
 
 		 123 aa  47.4  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0811165  normal  0.123076 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1827  type IV pilus assembly PilZ  27.36 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4150  Type IV pilus assembly PilZ  28.57 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4350  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  34.43 
 
 		 248 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767241  normal  0.344464 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4333  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  33.82 
 
 		 248 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4201  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 262 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4356  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  33.82 
 
 		 248 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509549  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1635  type IV pilus assembly PilZ  28.57 
 
 		 118 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02715  type IV fimbriae assembly protein  31.37 
 
 		 114 aa  44.3  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450475  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2201  type 4 fimbrial biogenesis protein PilZ  28.57 
 
 		 118 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25770  type 4 fimbrial biogenesis protein PilZ  28.57 
 
 		 118 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.961132  normal  0.553234 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3825  type IV pilus biogenesis protein PilZ  28.57 
 
 		 118 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0373515  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0879  type IV pilus assembly PilZ  30.39 
 
 		 117 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2856  type IV pilus assembly PilZ  25.64 
 
 		 126 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1414  type IV pilus assembly PilZ  28.3 
 
 		 120 aa  43.9  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.152869  normal  0.660499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0514  hypothetical protein  30.39 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0854508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1654  Type IV pilus assembly PilZ  28.57 
 
 		 118 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal  0.307598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0489  type IV pilus assembly PilZ  27.27 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0040  response regulator  27.83 
 
 		 239 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000155004  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1858  type IV pilus assembly protein  25.22 
 
 		 129 aa  42.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.595679 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1915  type IV pilus assembly protein PilZ, putative  29.13 
 
 		 118 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1590  type IV pilus assembly PilZ  29.13 
 
 		 118 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0382259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14990  type IV pilus assembly protein  30.61 
 
 		 118 aa  42.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1436  Type IV pilus assembly PilZ  22.94 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3390  type IV pilus assembly PilZ  25.23 
 
 		 119 aa  42  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381125 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2501  type IV pilus assembly PilZ  26.45 
 
 		 121 aa  41.6  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.313407  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6010  type IV pilus assembly PilZ  27.5 
 
 		 138 aa  41.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3410  type IV pilus assembly PilZ  25.69 
 
 		 119 aa  41.2  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.595597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1573  type IV pilus assembly PilZ  27.55 
 
 		 116 aa  41.2  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1658  Type IV pilus assembly PilZ  30.95 
 
 		 123 aa  41.2  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0211682  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2304  putative type IV pilus biogenesis protein pilZ  25.49 
 
 		 108 aa  41.2  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1994  type 4 fimbrial biogenesis protein PilZ  29.59 
 
 		 118 aa  40.8  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>