23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2870 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2870  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  795    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2801  hypothetical protein  98.77 
 
 
405 aa  784    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936301  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3862  hypothetical protein  49.6 
 
 
402 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1492  hypothetical protein  40.35 
 
 
398 aa  206  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113639  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3976  hypothetical protein  40.31 
 
 
427 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.667235  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_003296  RS03693  hypothetical protein  39.56 
 
 
416 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657787  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0539  hypothetical protein  38.93 
 
 
412 aa  165  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1083  hypothetical protein  37.89 
 
 
422 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000423957  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0488  hypothetical protein  40.61 
 
 
427 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0113931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0169  hypothetical protein  35.26 
 
 
466 aa  123  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2613  hypothetical protein  37.5 
 
 
480 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0259384  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0630  hypothetical protein  28.43 
 
 
414 aa  99.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0870  hypothetical protein  33.33 
 
 
389 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2670  hypothetical protein  29.64 
 
 
402 aa  89.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5501  hypothetical protein  33.48 
 
 
465 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000679714  hitchhiker  0.00404063 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0301  hypothetical protein  25 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0381  hypothetical protein  25.66 
 
 
403 aa  67  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1179  hypothetical protein  23.81 
 
 
398 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2247  hypothetical protein  21.66 
 
 
383 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5098  hypothetical protein  29.3 
 
 
464 aa  53.9  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0121004  normal  0.708615 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0248  hypothetical protein  21.56 
 
 
410 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1073  hypothetical protein  28.95 
 
 
435 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2034  hypothetical protein  23.21 
 
 
384 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>