24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0988 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0988  hypothetical protein  100 
 
 
990 aa  2004    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.318965  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  47.78 
 
 
1147 aa  579  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6514  hypothetical protein  49.43 
 
 
651 aa  165  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3071  PKD domain containing protein  32.97 
 
 
1067 aa  157  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192813  normal  0.491387 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1406  hypothetical protein  40.96 
 
 
396 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332746  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4489  hypothetical protein  48.8 
 
 
319 aa  144  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.488935  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1678  hypothetical protein  43.12 
 
 
940 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507171  hitchhiker  0.000632186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3634  hypothetical protein  51.75 
 
 
482 aa  118  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  hitchhiker  0.000640384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3953  hypothetical protein  27.39 
 
 
596 aa  87  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.584499  normal  0.585033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1506  hypothetical protein  59.02 
 
 
367 aa  86.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00662762  hitchhiker  0.0000622749 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0815  hypothetical protein  26.72 
 
 
457 aa  77  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0109394  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2844  hypothetical protein  32.9 
 
 
652 aa  75.9  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0262181  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0754  EGF calcium-binding domain protein  41.23 
 
 
460 aa  68.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1391  EGF calcium-binding domain protein  40.54 
 
 
428 aa  68.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.510113  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4742  hypothetical protein  27.31 
 
 
638 aa  62  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.681757 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  27.11 
 
 
1407 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  28.14 
 
 
1407 aa  55.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  27.11 
 
 
1407 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  28.87 
 
 
1406 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1383  EGF calcium-binding domain protein  29.19 
 
 
387 aa  51.6  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1717  Disintegrin  45.65 
 
 
313 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0506026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  46.94 
 
 
5517 aa  45.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  32.28 
 
 
1337 aa  44.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  32.28 
 
 
1337 aa  44.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>