15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0250 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0250  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  442  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.802054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0643  type IV pilus biogenesis protein PilO  26.44 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0688  type IV pilus biogenesis protein PilO  28.31 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0677  Pilus assembly protein PilO  25.86 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0677  type IV pilus biogenesis protein PilO  25.86 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211189  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1471  hypothetical protein  26.4 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.229275  normal  0.300377 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2136  pilus assembly protein, PilO-like  22.16 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000460184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1812  pilus assembly protein, PilO  23.42 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45280  Pilus assembly protein  26.53 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0828  pilus assembly protein, PilO  27.42 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0235  pilus assembly protein PilO  25.17 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.613869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5779  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  24.83 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66640  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  24.16 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4116  pilus assembly protein PilO  22.89 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0407  pilus assembly protein, PilO  25.68 
 
 		 207 aa  42  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0292492  normal  0.350599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>