43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1496 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1496  Protein of unknown function DUF2442  100 
 
 
78 aa  164  5e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367948  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1569  hypothetical protein  45.07 
 
 
82 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.997179  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1342  hypothetical protein  44.78 
 
 
80 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0271  hypothetical protein  36 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1387  hypothetical protein  44.78 
 
 
80 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0240  hypothetical protein  35.44 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2429  hypothetical protein  40.54 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2500  hypothetical protein  42.25 
 
 
85 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00388461  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0192  hypothetical protein  35.62 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.77367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3956  hypothetical protein  39.66 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1246  hypothetical protein  35.53 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1329  Protein of unknown function DUF2442  33.8 
 
 
79 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2376  hypothetical protein  34.21 
 
 
80 aa  57  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0363  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like  40.58 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000167862  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1439  hypothetical protein  34.67 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.766966  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0568  hypothetical protein  33.33 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2568  hypothetical protein  36.11 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1211  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  37.5 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.56263  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2137  hypothetical protein  36.11 
 
 
89 aa  53.9  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.309843  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00619  hypothetical protein  40.58 
 
 
86 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  40.58 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1000  hypothetical protein  39.73 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130432  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5000  hypothetical protein  42.19 
 
 
74 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0923  hypothetical protein  40.32 
 
 
91 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0674  hypothetical protein  39.73 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1477  hypothetical protein  43.59 
 
 
104 aa  51.2  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1018  hypothetical protein  30.26 
 
 
106 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1403  hypothetical protein  36.62 
 
 
99 aa  50.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1285  hypothetical protein  36.62 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0662  hypothetical protein  36.49 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.6245  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0654  hypothetical protein  37.84 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.169854  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2540  hypothetical protein  32.86 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3622  hypothetical protein  35.48 
 
 
84 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1900  hypothetical protein  37.88 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.030985 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4194  hypothetical protein  35.62 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0492  hypothetical protein  30.99 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29977  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2658  hypothetical protein  35.59 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0823788  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0265  hypothetical protein  33.9 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0906  hypothetical protein  35.59 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.866498  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0896  hypothetical protein  33.8 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89715  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1410  hypothetical protein  32.88 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.314119  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0513  hypothetical protein  47.22 
 
 
68 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1819  hypothetical protein  28.57 
 
 
118 aa  40.4  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>