23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_R0040 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_R0040  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0046  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0015  tRNA-Glu  95.16 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0154523  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0043  tRNA-Glu  93.22 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0048  tRNA-Glu  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0011  tRNA-Glu  90 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0580345  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0019  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0046  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0032  tRNA-Glu  95.12 
 
 		 111 bp  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0042  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.835093  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0048  tRNA-Glu  87.1 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.200275 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0016  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0030  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0067  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.772676  normal  0.0107371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0068  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.544619  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0050  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.259835 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0016  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0002  tRNA-OTHER  91.18 
 
 		 80 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.087724 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_0  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00654824 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0039  tRNA-OTHER  91.18 
 
 		 92 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.147165  hitchhiker  0.000226333 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0001  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0017  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0029  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>