19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3390 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3390  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 130 aa  269  9e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4295  transcriptional regulator, TrmB  79.67 
 
 		 135 aa  216  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3986  transcriptional regulator, TrmB  78.86 
 
 		 135 aa  214  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.958939  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3632  transcriptional regulator, TrmB  73.23 
 
 		 133 aa  209  9e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2144  transcriptional regulator, TrmB  71.09 
 
 		 134 aa  205  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0817  transcriptional regulator, TrmB  78.15 
 
 		 134 aa  198  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2097  transcriptional regulator TrmB  31.3 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0714  transcriptional regulator, TrmB  31.09 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1748  transcriptional regulator, TrmB  30.25 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0154  transcriptional regulator, TrmB  30.25 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.487715  normal  0.0526976 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0728  transcriptional regulator, TrmB  32.61 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.22819  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0014  transcriptional regulator, TrmB  26.5 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.682046  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0146  transcriptional regulator, TrmB  26.15 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1080  hypothetical protein  24.32 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0781  transcriptional regulator, TrmB  28.71 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.44791 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0320  transcriptional regulator, TrmB  26.36 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2705  transcriptional regulator, TrmB  24.51 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1140  hypothetical protein  22.94 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 275 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>