40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3547 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3547  protein of unknown function DUF1508  100 
 
 		 166 aa  330  5e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2527  protein of unknown function DUF1508  36.77 
 
 		 224 aa  87  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.595982  normal  0.191056 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0562  protein of unknown function DUF1508  34.34 
 
 		 211 aa  86.3  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0423  protein of unknown function DUF1508  36.13 
 
 		 214 aa  85.9  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.558642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2713  protein of unknown function DUF1508  58.93 
 
 		 523 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953901  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2960  protein of unknown function DUF1508  54.1 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2647  protein of unknown function DUF1508  59.18 
 
 		 557 aa  68.2  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2059  protein of unknown function DUF1508  51.79 
 
 		 509 aa  65.1  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3815  hypothetical protein  50.94 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.272281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1407  hypothetical protein  39.29 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1307  hypothetical protein  47.27 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.280375  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2330  protein of unknown function DUF1508  47.27 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1117  hypothetical protein  45.45 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1089  hypothetical protein  43.64 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2572  hypothetical protein  42.59 
 
 		 61 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259353  normal  0.786456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2504  protein of unknown function DUF1508  42.59 
 
 		 61 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2795  protein of unknown function DUF1508  42.59 
 
 		 61 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0497827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1640  protein of unknown function DUF1508  40.74 
 
 		 956 aa  49.7  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2678  hypothetical protein  40.74 
 
 		 969 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7854  protein of unknown function DUF1508  39.58 
 
 		 101 aa  47.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1074  protein of unknown function DUF1508  38.89 
 
 		 1001 aa  47.8  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1660  hypothetical protein  40.91 
 
 		 91 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.411815  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7233  protein of unknown function DUF1508  39.62 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458818  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1927  hypothetical protein  37.7 
 
 		 65 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000062835  decreased coverage  0.000000000000486624 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0826  hypothetical protein  37.04 
 
 		 58 aa  45.8  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0265  hypothetical protein  41.1 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0909482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6482  hypothetical protein  43.9 
 
 		 61 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.068016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3548  protein of unknown function DUF1508  35.71 
 
 		 62 aa  44.3  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1108  hypothetical protein  41.67 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1784  hypothetical protein  38.18 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0566644  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1710  hypothetical protein  35.14 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5390  protein of unknown function DUF1508  35.59 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3251  protein of unknown function DUF1508  32.14 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.85625  normal  0.147976 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2013  hypothetical protein  38.89 
 
 		 110 aa  42  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2168  hypothetical protein  38.78 
 
 		 127 aa  41.6  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276428  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2018  protein of unknown function DUF1508  41.67 
 
 		 111 aa  41.2  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00680  hypothetical protein  37.68 
 
 		 75 aa  40.8  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2613  hypothetical protein  44.23 
 
 		 110 aa  40.8  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40017  normal  0.147293 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0113  hypothetical protein  32.73 
 
 		 62 aa  40.8  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1529  hypothetical protein  38.78 
 
 		 111 aa  40.4  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>