39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2647 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2647  protein of unknown function DUF1508  100 
 
 
557 aa  1102    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2713  protein of unknown function DUF1508  43.88 
 
 
523 aa  434  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953901  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2059  protein of unknown function DUF1508  46.01 
 
 
509 aa  421  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2678  hypothetical protein  26.72 
 
 
969 aa  189  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1640  protein of unknown function DUF1508  24.51 
 
 
956 aa  155  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1074  protein of unknown function DUF1508  25.52 
 
 
1001 aa  153  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0423  protein of unknown function DUF1508  52.27 
 
 
214 aa  137  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.558642  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2527  protein of unknown function DUF1508  38.32 
 
 
224 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.595982  normal  0.191056 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4120  protein of unknown function DUF1508  29.55 
 
 
872 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2960  protein of unknown function DUF1508  68 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0562  protein of unknown function DUF1508  58.49 
 
 
211 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3547  protein of unknown function DUF1508  58.49 
 
 
166 aa  70.9  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0443  putative permease  28.47 
 
 
325 aa  63.9  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709158  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1307  hypothetical protein  53.85 
 
 
62 aa  63.9  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.280375  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1117  hypothetical protein  51.92 
 
 
62 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1089  hypothetical protein  51.92 
 
 
61 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3815  hypothetical protein  55.32 
 
 
61 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.272281  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2613  hypothetical protein  39.32 
 
 
110 aa  59.7  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40017  normal  0.147293 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2330  protein of unknown function DUF1508  59.57 
 
 
64 aa  60.1  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2795  protein of unknown function DUF1508  52.27 
 
 
61 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0497827  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2504  protein of unknown function DUF1508  52.27 
 
 
61 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.62676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2572  hypothetical protein  52.27 
 
 
61 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259353  normal  0.786456 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2168  hypothetical protein  34.23 
 
 
127 aa  58.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276428  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1407  hypothetical protein  45 
 
 
64 aa  58.2  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7233  protein of unknown function DUF1508  52.27 
 
 
61 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458818  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2018  protein of unknown function DUF1508  34.21 
 
 
111 aa  54.7  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6482  hypothetical protein  45.45 
 
 
61 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.068016  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0972  hypothetical protein  43.4 
 
 
56 aa  52.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.859574  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0826  hypothetical protein  44.64 
 
 
58 aa  50.4  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2466  protein of unknown function DUF1508  30.89 
 
 
110 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.675831  normal  0.26549 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1802  hypothetical protein  31.91 
 
 
299 aa  49.3  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5390  protein of unknown function DUF1508  53.85 
 
 
226 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1784  hypothetical protein  42.31 
 
 
129 aa  47.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0566644  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1529  hypothetical protein  32.43 
 
 
111 aa  47  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2608  hypothetical protein  30.36 
 
 
109 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.1772  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7854  protein of unknown function DUF1508  35.8 
 
 
101 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2449  protein of unknown function DUF1508  40.35 
 
 
61 aa  45.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3003  protein of unknown function DUF1508  31.19 
 
 
109 aa  44.3  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.589476  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3560  hypothetical protein  28.45 
 
 
112 aa  43.9  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>