42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2527 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2527  protein of unknown function DUF1508  100 
 
 		 224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.595982  normal  0.191056 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0423  protein of unknown function DUF1508  60.85 
 
 		 214 aa  265  4e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.558642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2647  protein of unknown function DUF1508  38.32 
 
 		 557 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2713  protein of unknown function DUF1508  47.76 
 
 		 523 aa  126  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953901  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2059  protein of unknown function DUF1508  46.4 
 
 		 509 aa  115  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3547  protein of unknown function DUF1508  36.77 
 
 		 166 aa  87  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0562  protein of unknown function DUF1508  32.11 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1640  protein of unknown function DUF1508  34.4 
 
 		 956 aa  78.6  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1307  hypothetical protein  54.39 
 
 		 62 aa  72.4  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.280375  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2330  protein of unknown function DUF1508  56.67 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2613  hypothetical protein  38.58 
 
 		 110 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40017  normal  0.147293 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2960  protein of unknown function DUF1508  51.85 
 
 		 298 aa  67  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1117  hypothetical protein  52.63 
 
 		 62 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1089  hypothetical protein  52.63 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2678  hypothetical protein  29.57 
 
 		 969 aa  66.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1074  protein of unknown function DUF1508  27.59 
 
 		 1001 aa  65.1  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4120  protein of unknown function DUF1508  26.72 
 
 		 872 aa  58.9  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2168  hypothetical protein  32.59 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276428  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2018  protein of unknown function DUF1508  35.48 
 
 		 111 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7854  protein of unknown function DUF1508  45.16 
 
 		 101 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2504  protein of unknown function DUF1508  41.51 
 
 		 61 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2795  protein of unknown function DUF1508  41.51 
 
 		 61 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0497827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2572  hypothetical protein  41.51 
 
 		 61 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259353  normal  0.786456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3815  hypothetical protein  48.94 
 
 		 61 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.272281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1529  hypothetical protein  31.45 
 
 		 111 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7233  protein of unknown function DUF1508  41.51 
 
 		 61 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458818  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3251  protein of unknown function DUF1508  40.68 
 
 		 62 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.85625  normal  0.147976 
 
 
-
 
NC_004310  BR0972  hypothetical protein  42.59 
 
 		 56 aa  49.3  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.859574  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1108  hypothetical protein  37.04 
 
 		 95 aa  49.3  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3548  protein of unknown function DUF1508  37.29 
 
 		 62 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2608  hypothetical protein  31.3 
 
 		 109 aa  47.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.1772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6482  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.068016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5390  protein of unknown function DUF1508  41.3 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1881  hypothetical protein  34.34 
 
 		 94 aa  46.6  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.132481 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0826  hypothetical protein  48.15 
 
 		 58 aa  46.2  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1407  hypothetical protein  41.79 
 
 		 64 aa  46.2  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2679  hypothetical protein  37.5 
 
 		 58 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3560  hypothetical protein  28.69 
 
 		 112 aa  43.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1784  hypothetical protein  35.19 
 
 		 129 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0566644  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2449  protein of unknown function DUF1508  34.48 
 
 		 61 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0113  hypothetical protein  38.89 
 
 		 62 aa  42.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2466  protein of unknown function DUF1508  29.27 
 
 		 110 aa  42  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.675831  normal  0.26549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>