17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1483 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 194 aa  390  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.293758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2986  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.19 
 
 		 178 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0365078  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3091  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.97 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4247  cupin 2 domain-containing protein  35.38 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4181  cupin 2, barrel  35.38 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4403  cupin 2 domain-containing protein  35.38 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4626  cupin 2, barrel  34.38 
 
 		 144 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4922  cupin 2, barrel  34.38 
 
 		 144 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4539  cupin 2, barrel  34.38 
 
 		 150 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  26.8 
 
 		 141 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5112  cupin 2 domain-containing protein  36.14 
 
 		 158 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5003  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.76 
 
 		 144 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190773  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.16 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.96 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0588  cupin 2 domain-containing protein  41.18 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00966189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  34.07 
 
 		 135 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>