20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1178 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1178  Protein of unknown function DUF63  100 
 
 
384 aa  754    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000653085 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0688  Protein of unknown function DUF63  52.91 
 
 
375 aa  341  1e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.216343  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2075  Protein of unknown function DUF63  50.66 
 
 
374 aa  333  3e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2950  Protein of unknown function DUF63  50.13 
 
 
383 aa  332  5e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.153375  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2221  Protein of unknown function DUF63  44.91 
 
 
388 aa  290  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.583411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0290  hypothetical protein  27.36 
 
 
285 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.51391  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2044  hypothetical protein  28.2 
 
 
281 aa  87.8  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1137  hypothetical protein  27.55 
 
 
281 aa  87  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2965  Protein of unknown function DUF63  31.54 
 
 
273 aa  85.9  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0476727  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1031  hypothetical protein  26.76 
 
 
283 aa  84  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1961  hypothetical protein  28.62 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.987254 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0570  Protein of unknown function DUF63  29.03 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0947  Protein of unknown function DUF63  25.35 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1931  Protein of unknown function DUF63  32.44 
 
 
271 aa  61.2  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0470483  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2997  hypothetical protein  32.26 
 
 
280 aa  56.6  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.217193  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1309  SMC domain-containing protein  23.99 
 
 
278 aa  55.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1525  Protein of unknown function DUF63  27.55 
 
 
277 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1165  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  52.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.249015  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1339  hypothetical protein  32.14 
 
 
268 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1345  hypothetical protein  21.81 
 
 
268 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>